幻のコーヒー「ユーゲニオイデス」とは？〜特徴とその背景を読み解く〜
以前に、2026年に突如明らかになった「ブラジル産ユーゲニオイデス」について書きました。
Yuta Hayashi
今回はそもそものユーゲニオイデスという種について、一度きちんとまとめておこうと思います。
ユーゲニオイデスの特徴をまずは整理しながら、後半では、私がいま遺伝子解析について学んでいる視点から「なぜそうなるのか」を遺伝子の話まで踏み込んで書いてみます。
前半だけ読めば、基本的にはユーゲニオイデスという種のコーヒーについての理解は深まるはずです。
そもそもユーゲニオイデスとは？
ユーゲニオイデス（Coffea eugenioides）とは、私たちが普段飲んでいる「アラビカ種」の親にあたる、非常に希少なコーヒーの種の名前です。
ここで一つ押さえておきたいのは、ユーゲニオイデスは「品種 Variety」ではなく「種 Species」だということです。
ゲイシャやブルボン、ティピカはすべてアラビカ種の中の「品種 Variety」ですが、ユーゲニオイデスはアラビカと並ぶ、別の「種 Species」となります。
コーヒー属には130種以上の種があるとされ、私たちが飲んでいるのはそのうちアラビカとカネフォラ（ロブスタ）の2種がほとんどであり、ユーゲニオイデスはその「ほとんど飲まれていない」側の一つです。
アラビカ種の祖先
近年の遺伝子解析によって、アラビカ種はユーゲニオイデス種とカネフォラ種の自然交配によって生まれたことが判明しています。
つまり、私たちが毎日コーヒーショップで買って飲んでいる、ティピカやブルボン、ゲイシャなどを含む、アラビカ種のさらに親にあたる種です。
アラビカ種がもつ香り、甘み、果実感の多くは、このユーゲニオイデス側の遺伝子に由来すると考えられています。
天然の超低カフェイン種
ユーゲニオイデスを特徴づけているのが、そのカフェイン含有量の少なさです。
生豆のカフェイン量はわずか約0.4%。アラビカの1/3〜1/2程度しかありません。
化学的な脱カフェイン処理を行わずに、自然の状態でカフェインが抑えられているため、ローリナ / Laurina（0.4〜0.6%）や、ラセモサ / Racemosa（0.3〜0.8%）などと並んで「天然の低カフェイン種」として、健康意識の高いコーヒー好きからも注目されています。
ちなみに、アラビカ種のカフェイン量は約1.0〜1.5%程度、アラビカ種のもう片方の親であるカネフォラ（ロブスタ）種が約2.2〜2.7%程度とされ、アラビカ種はきれいに両親の中間程度のカフェイン量に位置しています。
これはまさに、カネフォラ由来とユーゲニオイデス由来の遺伝子が両方働いた結果である、といえます。
なお、そもそもなぜユーゲニオイデスがこれほどカフェインが少ないのかについては、後半で詳しく書きます。実はユーゲニオイデスは、他の低カフェイン種とは少し違う仕組みでカフェインを抑えていることが分かっています。
圧倒的な甘み
ユーゲニオイデスのコーヒーが人々を魅了しているのは、その圧倒的な甘さです。
これは苦味や渋みのもとになるカフェインやクロロゲン酸などの成分が少ないことに起因しており、苦味・酸味ともに非常に少なく、ブラックでもまるで砂糖が入っているかのような強い甘みと、フルーティーなフレーバーが特徴とされています。
私が過去に飲んだ経験からも、苦味や雑味は全くと言っていいほどなく、酸味も少なく、フルーツジュースのように甘い。かといってしつこい甘さではなく軽やかで、その甘さが余韻として口に長く残るのも印象的でした。
甘さがありつつも、砂糖のように舌に残る重さはなく、軽やかであるため、天然の甘味料である「ステビア」がフレーバーとして表現されることもあります。
市場ではほとんど出回らない幻のコーヒー
ユーゲニオイデスの原産地は東アフリカの高地で、ケニア、ウガンダ、タンザニア、ルワンダなどの標高1,000〜2,000mの地域に、今も野生の状態で生育しているといわれています。
商業的に栽培され、コーヒーとして市場に出るようになったのはごく最近のことです。
2021年のワールド・バリスタ・チャンピオンシップ決勝で、1〜3位のバリスタ全員がユーゲニオイデスを使用したことで一躍話題になりましたが、このとき使われた豆はすべて、コロンビアの著名な農園「Inmaculada Coffee Farms（インマクラーダ・コーヒー・ファームズ）」のものでした。
以降2025年頃まで、市場に流通するユーゲニオイデスは実質的にインマクラーダ産のみという状態が続いていました。
そこに2026年、ブラジルの農園がユーゲニオイデスを栽培していることが突如明らかになった、というのが以前に書いた記事の内容です。
Yuta Hayashi
なぜそこまで栽培されていないのか？
理由は単純で、栽培が極端に難しいゆえ、採れる量が極端に少ないからです。
まったく品種改良がされていないことから、サビ病をはじめほぼすべてのコーヒーの病害に弱く、霜や直射日光にも耐えられません。
木も小さく、実も小さく、1本の木から1年間に採れる生豆はわずか150g程度。
つまりユーゲニオイデスの希少性は、種としての珍しさだけでなく、育てても割に合わないゆえの流通量の少なさにもある、ということがわかります。
まさに超稀少なコーヒーであり、私の体感でも「毎年わずか数ヶ月、そしてどこの国の、どこのロースターが買い付けたのか」をウォッチしていないと、まずお目にかかれることは難しい、という印象です。
なぜユーゲニオイデスはカフェインが少ないのか？
ここがユーゲニオイデスの最も面白いところ。
コーヒー属には低カフェインの種がいくつかありますが、実はその仕組みは種によって違います。
ほとんどの低カフェイン種では、カフェインを作る速度が遅いために、蓄積する量が少なくなっています。
ところがユーゲニオイデスだけは、作る速度が遅いことに加え、作ったカフェインを自分で分解してしまう能力を持っています。
この2つの要因により、カフェインの含有量が少ないのです。
葉にカフェインを意図的に与える実験では、アラビカやカネフォラではカフェインがほぼそのまま残るのに対し、ユーゲニオイデスでは数日のうちに二酸化炭素とアンモニアにまで完全に分解されることが確認されています。
この分解の第一段階を担う酵素（カフェインデメチラーゼ）の活性が、他種と比べて突出して高いのです。
カフェインを分解する経路を持っているコーヒーの種としては、ユーゲニオイデスは今のところ唯一と言ってよい存在なのです。
※ 一点だけ注記しておくと、この分解の研究は主に「葉」で行われたもので、私たちがコーヒーとして飲んでいる「種子」で同じことが起きているかは、まだはっきりしていません。種子のカフェインが約0.4%であること自体は確かですが、その低さのうちどれだけが「分解」によるものかは未確定です。
アラビカ種の誕生〜100万年前に起きた奇跡〜
ここまでユーゲニオイデスの特徴を解説しました。
ユーゲニオイデスについて深掘っていると、カネフォラ（ロブスタ）種との交配によって、アラビカ種が誕生したストーリーもまた大変に興味深いものでした。
アラビカ種の誕生は100万年前の奇跡
アラビカ種は、およそ100万〜50万年前、東アフリカでユーゲニオイデスとカネフォラが自然に交配して生まれました。
ただし、これは「たまたま近くに生えていたから交配した」というような話ではありません。
カネフォラ種とユーゲニオイデス種はもともと生育環境が全く異なります。カネフォラは低地の湿った森林、ユーゲニオイデスは高地の乾いた林縁（森林の周縁部）。
しかも開花時期も異なり、普通に考えれば自然交配することなどあり得ません。
そして仮に交配できたとしても、通常、異なる種同士の雑種は種子を作れません。
では、なぜアラビカは生まれたのか？
有力な説は、更新世の気候変動によって両種の生息域と開花時期が、ごく一時的に重なり、さらに気温などの要因によって「染色体を減らさない特殊な花粉や卵（未減数配偶子）」が作られやすくなった、というものです。
これらの複数の偶然が重なったことで、雑種でありながら正常に種子を作れる個体がたまたま誕生した。
そしてこの「染色体を減らさない配偶子」同士が受精した結果、生まれた子は両親の染色体を減らすことなく、丸ごと受け継ぐことになりました。それが次に出てくる「四倍体」の話です。
アラビカは両親のゲノムを「丸ごと2つ」持っている
ユーゲニオイデスもカネフォラも、染色体を22本持つ「二倍体」です。
一方、アラビカは染色体を44本持つ「四倍体」で、コーヒー属130種以上の中で唯一の「四倍体」です。
なぜ44本かといえば、ユーゲニオイデス由来の22本と、カネフォラ由来の22本を両方そのまま持っているからです。
このような成り立ちを経た四倍体を「異質四倍体」と呼びます。
つまりアラビカの細胞の中には、ユーゲニオイデスの遺伝子一式と、カネフォラの遺伝子一式が、それぞれ別々に保存されています。アラビカ種がカネフォラ種の丈夫さと、ユーゲニオイデス種の香りや甘みの両方を受け継いでいるのは、このためです。
ただし、遺伝子一式を持っていることと、その性質がすべて現れることは別で、ユーゲニオイデスが持つ「カフェインを分解する」能力は見られません。
設計図は受け継いでも、それをどう使うかはアラビカという新しい種の中で決まり、100万年の間に使われない遺伝子は弱まっていったと考えられます。
このまさに奇跡ともいえる交配によって、現在世界中に流通するアラビカ種のコーヒーが誕生し、私たちはそのコーヒーを日々楽しんでいるのです。
まとめ
ユーゲニオイデスは「稀少なコーヒー」として知られていますが、この記事を通して、それが単に「手に入りにくい」というだけでなく、特徴自体が他のコーヒーとは大きく異なる、という点にも理解が深まっていたら嬉しいです。
コーヒー好きなら、人生で一度はお目にかかりたい幻のユーゲニオイデス。
もし出会う機会があったならば、今回お伝えしたことを頭の片隅に置きながら、より深く、その稀少さを思う存分楽しんでいただけたら幸いです。
主な参考文献
- Ashihara, H., & Crozier, A. (1999). Biosynthesis and catabolism of caffeine in low-caffeine-containing species of Coffea. Journal of Agricultural and Food Chemistry, 47(8), 3425–3431. https://doi.org/10.1021/jf981209n
- Ashihara, H., Sano, H., & Crozier, A. (2008). Caffeine and related purine alkaloids: Biosynthesis, catabolism, function and genetic engineering. Phytochemistry, 69(4), 841–856.
- Campa, C., Doulbeau, S., Dussert, S., Hamon, S., & Noirot, M. (2005). Diversity in bean caffeine content among wild Coffea species: evidence of a discontinuous distribution. Food Chemistry, 91(4), 633–637.
- Lashermes, P., Combes, M.-C., Robert, J., et al. (1999). Molecular characterisation and origin of the Coffea arabica L. genome. Molecular and General Genetics, 261, 259–266.
- Scalabrin, S., Toniutti, L., Di Gaspero, G., et al. (2020). A single polyploidization event at the origin of the tetraploid genome of Coffea arabica is responsible for the extremely low genetic variation in wild and cultivated germplasm. Scientific Reports, 10, 4642. https://doi.org/10.1038/s41598-020-61216-7
- Salojärvi, J., et al. (2024). The genome and population genomics of allopolyploid Coffea arabica reveal the diversification history of modern coffee cultivars. Nature Genetics, 56, 721–731.
- Ramsey, J., & Schemske, D. W. (1998). Pathways, mechanisms, and rates of polyploid formation in flowering plants. Annual Review of Ecology and Systematics, 29, 467–501.
- Davis, A. P., Govaerts, R., Bridson, D. M., & Stoffelen, P. (2006). An annotated taxonomic conspectus of the genus Coffea (Rubiaceae). Botanical Journal of the Linnean Society, 152(4), 465–512.
- Reuters (2026年3月24日). Brazil farmer aims to fetch near $20,000 per bag of rare eugenioides coffee.
